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省茶叶研究所成功组装贵州首个茶树良种基因组

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我所茶树资源育种团队联合西北农林科技大学相关研究团队,成功组装了‘黔茶1号’基因组,构建了三维基因组图谱,分析了香气物质代谢调控网络,实现了贵州自育茶树良种基因组组装“零突破”。相关成果以“Three-dimensional genomic structure and aroma formation in the tea cultivar 'Qiancha 1'”为题发表于国际权威期刊《Horticulture Research》。

该研究以贵州自主品种‘黔茶1号’为材料,利用长读长高保真测序技术(PacBio HiFi)和染色体构象捕获技术(Hi-C)分别获得135Gb和430Gb测序数据,克服了茶树基因组庞大、高杂合与高重复等组装困难,获得 “最完整”基因组组装质量(BUSCO评估组装完整度达99.2%),其3.1Gb染色体级别基因组(Contig N50=132.6Mb)精准注释57115个蛋白编码基因(注释完整度97.9%)。

‘黔茶1号’基因组的组装,标志着贵州茶拥有了自己专属的“黔茶字典”,为利用组学分析和分子生物学技术挖掘“黔茶”特色功能基因、解析优异性状形成的遗传机制,加快茶树分子育种的应用,推动贵州特色茶树品种的高效选育,有望将新品种选育时间缩短50%以上。

该研究得到了贵州省茶产业技术体系(GZCYCYJSTX-02)、贵州省科研机构创新能力建设项目(黔科合服企[2019]4006和黔科合服企[2024]003-1)、贵州省农业农村厅茶叶专班项目(nynctcyzb20230901)、贵州省农科院种质资源专项(黔农科种质资源[2023]03)以及国家自然科学基金项目(32472794)的资助。省农科院茶叶研究所、农业农村部喀斯特山区作物基因资源与种质创新重点实验室乔大河副研究员和西北农林科技大学在读博士生雷文龙为论文共同第一作者,省农科院茶叶研究所陈正武研究员和西北农林科技大学王鹏杰教授为共同通讯作者。



    
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